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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

青海省西宁市委原副书记、市长孔令栋接受审查调查******

　　青海省西宁市委原副书记、市长孔令栋接受纪律审查和监察调查

　　中央纪委国家监委网站讯据青海省纪委监委消息：青海省西宁市委原副书记、市长孔令栋涉嫌严重违纪违法，目前正接受青海省纪委监委纪律审查和监察调查。

　　孔令栋简历

　　孔令栋，男，汉族，1970年12月出生，甘肃武威人，省委党校研究生学历，1990年8月参加工作，2000年7月加入中国共产党。

　　1988年9月至1990年7月，青海师范大学中文系文秘专业学习；

　　1990年8月至1999年12月，西宁市劳动局、经济委员会干部；

　　1999年12月至2001年1月，西宁市经济贸易委员会副主任科员；

　　2001年1月至2006年7月，西宁经济技术开发区经济发展局副局长、财政局副局长、招商中心副主任(正科级)；

　　2006年7月至2007年11月，西宁市城东区副区长(副处级)；

　　2007年11月至2010年10月，西宁经济技术开发区东川工业园区管委会副主任、南川工业园区管委会副主任；

　　2010年10月至2011年2月，西宁经济技术开发区调研员，东川工业园区管委会副主任(正处级)；

　　2011年2月至2012年2月，西宁经济技术开发区东川工业园区管委会主任、党委副书记；

　　2012年2月至2014年5月，西宁经济技术开发区党工委委员，东川工业园区管委会主任；

　　2014年5月至2016年7月，西宁市发展改革委主任、党组书记；

　　2016年7月至2019年6月，海东市副市长，海东工业园区管委会副主任(副厅级)；

　　2019年6月至2019年12月，西宁(国家级)经济技术开发区党工委副书记、管委会副主任；

　　2019年12月至2021年3月，西宁市委常委，西宁(国家级)经济技术开发区党工委常务副书记、管委会常务副主任(正厅级)；

　　2021年3月至2021年4月，西宁市委副书记、市长人选，西宁(国家级)经济技术开发区管委会主任，青海国家高新技术产业开发区管委会主任；

　　2021年4月至2021年9月，西宁市委副书记、市长，西宁(国家级)经济技术开发区管委会主任，青海国家高新技术产业开发区管委会主任；

　　2021年9月至2023年1月，西宁市委副书记、市长；

　　2023年1月，免去西宁市委副书记、市长职务。

(青海省纪委监委)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）